【現(xiàn)場(chǎng) | 線上】生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班

還在認(rèn)為沒有實(shí)驗(yàn)就不能發(fā)表論文？
手頭有很多數(shù)據(jù)，不知道該怎么進(jìn)一步挖掘？
還在為不知道如何找靶點(diǎn)而苦惱？
還在為不精通挖掘 GEO、TCGA 等數(shù)據(jù)庫而痛苦不堪？
還在為不會(huì)那些高大上的圖表而暗自傷神？
快來參加北京市計(jì)算中心舉辦的生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班吧！

本次培訓(xùn)對(duì)目前公共數(shù)據(jù)挖掘熱點(diǎn)進(jìn)行系統(tǒng)介紹，提供一次系統(tǒng)了解 TCGA、GEO、SRA、ENCODE 等數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)產(chǎn)生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數(shù)據(jù)庫挖掘多組學(xué)數(shù)據(jù)，以便為自身科研項(xiàng)目服務(wù)。歡迎報(bào)名參加。更多消息可關(guān)注「生信會(huì)議」公眾號(hào)，會(huì)給您帶來更多驚喜！

授課對(duì)象：
從事生物醫(yī)學(xué)研究的臨床醫(yī)生、轉(zhuǎn)化研究科研人員；
課題經(jīng)費(fèi)不足，無法進(jìn)行大規(guī)模測(cè)序，但需要發(fā)表 SCI 論文的相關(guān)研究人員；
已獲得轉(zhuǎn)錄組、基因組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，需要進(jìn)一步挖掘分析人員；
對(duì)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓(xùn)效果：
短、平、快，為基金申請(qǐng)保駕護(hù)航，發(fā)表 paper 如虎添翼；
掌握多組學(xué)數(shù)據(jù)分析核心技能，GEO、TCGA、SRA 數(shù)據(jù)處理沒有壓力；
科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；
一套數(shù)據(jù)多角度演練，更易掌握分析思路。

主辦單位：北京市計(jì)算中心

協(xié)辦單位：
北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心
云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
北京市計(jì)算中心—工信部和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地
北京市計(jì)算中心—北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

聽課方式：線上直播、現(xiàn)場(chǎng)聽課，按需選擇。

課程安排：2020 年 7 月 14-17 日 ? 上 9：30-11：30?? 下 13：30-17：00

第一天
公共數(shù)據(jù)庫挖掘熱點(diǎn)介紹
1、疾病診斷 biomarker 鑒定
2、疾病預(yù)后 biomarker 鑒定
3、可變剪切與預(yù)后相關(guān)分析
4、腫瘤免疫分析
5、多組學(xué)泛癌癥分析
6、人工智能研究在病理切片識(shí)別上的應(yīng)用
7、人工智能多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析
常用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹
1、用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹：
1）大型綜合數(shù)據(jù)庫：NCBI、UCSC
2）公共高通量測(cè)序數(shù)據(jù)庫：SRA
3）公共基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫：GEO
4）公共癌癥多組學(xué)數(shù)據(jù)庫：TCGA
2、各大數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)下載

第二天
R 語言基礎(chǔ)
1、R 語言簡(jiǎn)介
2、R 語言安裝及配置
3、R 語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
4、R 語言數(shù)據(jù)處理
5、R 語言繪圖
基于公共數(shù)據(jù)的 Biomarker 挖掘鑒定演練（一）
1、差異表達(dá)分析及結(jié)果可視化：
1）edgeR 包使用
2）火山圖繪制
3）聚類熱圖繪制
2、GO、KEGG 功能富集分析及結(jié)果可視化：
1）GO 富集分析
2）KEGG 富集分析
3）富集分析氣泡圖繪制

第三天
基于公共數(shù)據(jù)的 Biomarker 挖掘鑒定演練（二）
1、利用 string 數(shù)據(jù)庫查詢基因/蛋白相互作用
2、利用 cytoscape 工具構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò)
3、網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析、關(guān)鍵基因識(shí)別
基于公共數(shù)據(jù)的 Biomarker 挖掘鑒定演練（三）
預(yù)后相關(guān)性分析、生存曲線、ROC 曲線繪制：
1）利用 R 包進(jìn)行單因素及多因素預(yù)后分析
2）生存曲線繪制、生存曲線差異顯著性分析
3）RISK score 計(jì)算及結(jié)果可視化

第四天
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（一）
甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練
1）甲基化數(shù)據(jù)預(yù)處理
2）差異甲基化位點(diǎn)及區(qū)域識(shí)別
3）甲基化與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)聯(lián)合分析
4）公共表觀數(shù)據(jù)庫：ENCODE、regulomeDB
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（二）
lncRNA-miRNA-mRNA 全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練
1）lncRNA 表達(dá)譜數(shù)據(jù)獲取
2）miRNA 靶基因分析
3）lncRNA 與 mRNA 表達(dá)相關(guān)性分析
4）ceRNA 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及結(jié)果可視化
注：課程以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會(huì)提前通知。

報(bào)名費(fèi)用：
線上直播：4200 元/人
含本次聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi) (如有)。
贈(zèng)送一年內(nèi)同等金額同課程體系線下班一個(gè)和線下 7 折班一個(gè)（備注：若您不方便參加線下班可將贈(zèng)送的線下班換成 2 個(gè)線上班。）

現(xiàn)場(chǎng)聽課：3600 元/人
含本次聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi) (如有)。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。
課程結(jié)束后，可將上課期間用到的數(shù)據(jù)、PPT 資料、腳本、視頻等相關(guān)文檔，通過移動(dòng)硬盤郵寄的方式快遞到您手上，便于您后續(xù)繼續(xù)學(xué)習(xí)使用。

報(bào)名優(yōu)惠政策：
1、3 人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少 300 元；
2、4+1 團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；
3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；
老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠 200 元。
包年優(yōu)惠價(jià)：按年付費(fèi)，45000 元/人。包括報(bào)名后 1 年以內(nèi)所有線上課程；高性能計(jì)算資源基礎(chǔ)賬號(hào) 1 個(gè)，使用期限 1 年；線下培訓(xùn)名額 2 個(gè)。

付費(fèi)方式：
銀行賬號(hào)信息：
單位全稱：北京市計(jì)算中心
賬號(hào)：0200151819100023937
開戶銀行：中國(guó)工商銀行股份有限公司北京永豐支行
（匯款信息備注：「生物計(jì)算——您的姓名」, 個(gè)人匯款請(qǐng)備注單位名稱）
注：款項(xiàng)支出后，請(qǐng)?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實(shí)到賬、開具發(fā)票。

報(bào)名回執(zhí)：
復(fù)制此鏈接瀏覽器訪問并填寫報(bào)名回執(zhí)，https://www.wjx.top/jq/80710449.aspx

咨詢請(qǐng)聯(lián)系：
QQ 號(hào)：2814500767
郵箱：bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老師 010-59341786，15801436028（微信同號(hào)）
員老師 010-59341773，18701529461（微信同號(hào)）

【注】開課前三天會(huì)發(fā)送郵件通知；確認(rèn)開課后，開課前一天會(huì)將直播鏈接及上機(jī)賬號(hào)發(fā)至您郵箱或微信。如未收到，請(qǐng)及時(shí)電話咨詢。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

編輯： 會(huì)議君    來源：丁香園