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      生物信息學Python語言培訓(北京3月)

      作者:   2018-12-29
      字體大小:
      • 會議時間: 2019-03-12至 2019-03-15
      • 會議地點: 北京
      • 電話:18618295767
      • 傳真:暫無
      • 聯系人:張老師
      • Email: bcc_peixun@163.com
      • 聯系地址:北京市海淀區豐賢中路7號北科產業3號樓
      • 會議網址:

      生物信息學中常用的語言是Perl,不過最近Python語言很火,Python是一個高層次的結合了解釋性、編譯性、互動性和面向對象的腳本語言。它設計簡潔,具有很強的可讀性,相比其他語言更有特色的語法結構。Python目前擁有很多專用的科學計算擴展庫,生物信息學專用的Biopython,提供了生物信息學處理分析功能如快速數組處理、數值運算以及繪圖,已經有大量程序軟件全部或部分使用Python來設計。

      越來越多的科研人員學習Python語言處理實驗數據、制作圖表。在學習編程的路上,您可能看過很多Python電子書、Python教程和視頻依然不會Python編程!如果有個導師給您指導,您會走的更快、更好一些!北京市計算中心自2011年起已成功舉辦100多期生物信息類培訓班,學員累計達1500人次,其中不乏教授、博導。不少學員通過培訓建立了長期協作關系,共同申請國家課題,共同發表論文。特聘請行業一線項目經驗豐富的科研人員精心組織了生物信息學Python語言培訓課程,專業老師幫助大家學習編程語言,不用再擔心枯燥無味,學員與老師之間互動討論,可對重點知識實踐快速掌握,快速學會Python!誠邀您報名參加!

      培訓對象:從事生命科學、醫學、農學等領域科研工作者和高校教師及研究生及致力于從事生物信息分析的在校大學生及求職者

      主辦單位:中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專委會

      承辦單位:北京市計算中心

      舉辦地點:北京市海淀區豐賢中路7號北科產業3號樓

      培訓時間:2019.3.12-15(共4天)

      培訓內容及安排:

      日期

      時間

      授課題目

      授課內容

      第一天

      09:30-10:30

      Python概述及其在生物信息領域的應用

      概括介紹Python語言的概念及特點,及其在生物信息領域的應用

      10:30-12:00

      Python軟件安裝、運行與基本操作

      Python及iPython的安裝及使用,Python程序的運行;DOS、Unix命令行操作基本命令;Python變量定義、數字及基本運算

      13:30-15:00

      核心數據類型(1)

      列表、元組

      15:00-16:00

      基本語法結構

      判斷結構、循環結構、異常處理

      16:00-17:00

      實例練習

      使用python編程,生成斐波那契數字序列

      第二天

      09:30-11:00

      核心數據類型(2)

      字符串、字典

      11:00-13:00

      文件與文件夾操作

      文件的讀入與寫入、文件夾操作

      13:30-17:00

      實例練習

      FASTA文件的處理:1、序列基本信息的統計(序列數、堿基數、及平均長度);2、fasta序列反向互補轉換和切割

      第三天

      09:30-11:00

      函數和模塊

      系統庫函數、第三方函數、自定義函數;模塊定義、導入、使用

      11:00-12:00

      正則表達式

      Python特色功能正則表達式學習與應用

      13:30-14:30

      實例練習

      系統命令在python中的調用

      14:30-17:00

      實例練習

      大數據文件的分割及合并

      第四天

      09:30-11:00

      BioPython簡介及應用實例

      BioPython安裝及學習,生物信息學中的實際應用

      11:00-12:00

      BioPython快速應用

      使用BioPython處理傳統的生物信息數據

      15:00-17:00

      實例練習

      應用biopython實現genbank、uniprot格式數據轉換為fasta格式。
      應用biopython在blast xml結果文件中提取目的信息。

      (此表僅供參考,授課內容以實際授課為準)

      培訓特色:

      • 一流的講師團隊--基因組學專家與一線分析人員親自授課;

      • 全面的課程--技術應用、原理流程、實例聯系全貫穿

      • 理論知識與上機操作相結合,為每位學員提供實際操作機會

      • 增值服務,課下主講老師將為您實際工作中遇到的問題提供個性化解答

      • 小班教學,每期培訓班的人數不超過35人。

      報名費用:

      培訓費:4500元,含聽課費、材料費、上機費。請自帶筆記本電腦用以上機實習。材料:《高通量測序與高性能計算理論和實踐》北京科學技術出版社。食宿自理,酒店自行預定。

      【報名優惠政策】

      1、3人以上團體報名每人可減少300元;

      2、4+1團報,可免費贈送一個名額;

      3、上面優惠政策不能同時享受,只能享受其中一種。

      培訓以收到學員培訓費為成功報名,培訓座位按收到費用先后順序安排。


      編輯: 會議君   

      聲明:

      1.丁香會議頻道僅負責發布會議信息,如需參會、獲取邀請函或會議日程,請與主辦單位聯系

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