- 會(huì)議時(shí)間： 2019-04-12至 2019-04-15
- 會(huì)議地點(diǎn)： 北京
- 電話：18618295767
- 傳真：暫無
- 聯(lián)系人：張老師
- Email： bcc_peixun@163.com
- 聯(lián)系地址：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓
- 會(huì)議網(wǎng)址：
生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的產(chǎn)出已經(jīng)非常龐大，利用這些公共數(shù)據(jù)資源并融入自己的構(gòu)想，然后分析解決生物學(xué)問題將是以后的關(guān)鍵，也是目前科研的熱點(diǎn)。各種公共數(shù)據(jù)庫呈井噴式發(fā)展，如TCGA、GEO和SRA。TCGA（癌癥基因組圖譜）是全球最大的癌癥基因信息數(shù)據(jù)庫，是一個(gè)多組學(xué)的數(shù)據(jù)庫，包括常見癌癥的基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表觀遺傳組數(shù)據(jù)和與其關(guān)聯(lián)的臨床數(shù)據(jù)，為挖掘有意義的組學(xué)變化和發(fā)現(xiàn)腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移等生物學(xué)機(jī)制提供了海量數(shù)據(jù)。
GEO數(shù)據(jù)庫是當(dāng)今最大、最全面的公共基因表達(dá)數(shù)據(jù)資源。不僅可以上傳自己的數(shù)據(jù)，而且還可以免費(fèi)下載數(shù)據(jù)庫中和自己研究方向類似甚至相同的數(shù)據(jù)來進(jìn)行分析，為自己的研究提供一些啟示或者驗(yàn)證。SRA是NCBI上常用的一個(gè)數(shù)據(jù)庫。它接受通過二代測序技術(shù)產(chǎn)生的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)以及與其相關(guān)的質(zhì)控報(bào)告。
但是面對(duì)這些極其有價(jià)值的公共數(shù)據(jù)時(shí),科研人員往往心有余而力不足，而且面對(duì)市面上的浩如煙海的各類教程也是一頭霧水。本次培訓(xùn)提供了一次系統(tǒng)了解TCGA等數(shù)據(jù)產(chǎn)生，分析及挖掘的課程，幫助科研人員利用這些公共數(shù)據(jù)庫挖掘多組學(xué)數(shù)據(jù)，以便為自身科研項(xiàng)目服務(wù)。
授課對(duì)象：從事腫瘤研究的臨床醫(yī)生、轉(zhuǎn)化研究科研人員、在校研究生以及廣大臨床腫瘤研究領(lǐng)域的愛好者。
主辦單位：中國生物工程學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)專委會(huì)
承辦單位：北京市計(jì)算中心
舉辦地點(diǎn)：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓，北京市計(jì)算中心會(huì)議室
舉辦時(shí)間： 2019.4.12-15（報(bào)名中）上午9：30-12:00，下午13:30-17:00.
日期 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? | 時(shí)間 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? | 授課題目 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? | 授課內(nèi)容 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? |
第一天 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? | 上午 | Linux操作基礎(chǔ)及常見命令 | 1、Linux系統(tǒng)操作 2、基本上機(jī)命令 |
下午 | R語言基礎(chǔ)及實(shí)操 | 1、R語言簡介 2、R基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，各種軟件包下載和安裝 3、R編程基礎(chǔ)及語句判斷 | |
第二天 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? | 上午 | SRA數(shù)據(jù)庫介紹及使用 | 1、數(shù)據(jù)挖掘概述； 2、高通量組學(xué)研究基礎(chǔ)知識(shí)； 3、SRA數(shù)據(jù)庫在線工具的應(yīng)用； 4、SRA數(shù)據(jù)上傳與下載 |
下午 | GEO數(shù)據(jù)庫介紹及使用 | 1、GEO在線工具的應(yīng)用； 2、GEO數(shù)據(jù)下載和數(shù)據(jù)質(zhì)量分析； 3、GEO芯片數(shù)據(jù)處理 | |
第三天 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? | 上午 | TCGA數(shù)據(jù)庫介紹及使用 | 1、TCGA數(shù)據(jù)庫基本概念介紹及數(shù)據(jù)獲取 2、操作實(shí)戰(zhàn)：?TCGA數(shù)據(jù)獲取，不同類型數(shù)據(jù)的使用 3、基于發(fā)表文章的TCGA數(shù)據(jù)分析作圖實(shí)例 |
下午 | TCGA及生物網(wǎng)絡(luò)調(diào)控分析 | 1、基因表達(dá)譜的PPI網(wǎng)絡(luò)挖掘 2、利用cytoscape進(jìn)行miRNA-mRNA互作網(wǎng)絡(luò)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)上機(jī)操作 | |
第四天 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? | 上午 | 公共數(shù)據(jù)庫挖掘文獻(xiàn)解析1 | 1、基于TCGA和GEO數(shù)據(jù)挖掘文章的深度解析及復(fù)現(xiàn)（結(jié)合具體實(shí)例）； 2、如何做成發(fā)表文章中的圖表 |
下午 | 公共數(shù)據(jù)庫挖掘文獻(xiàn)解析2 | 1、經(jīng)典文獻(xiàn)解析及復(fù)現(xiàn)； 2、如何利用TCGA和GEO進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘及臨床轉(zhuǎn)化課題設(shè)計(jì) |
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(課程內(nèi)容以實(shí)際授課為準(zhǔn))
報(bào)名費(fèi)用：注冊(cè)費(fèi)：3000元/人，包括學(xué)費(fèi)、材料費(fèi)、午餐費(fèi)等。請(qǐng)自帶筆記本電腦。 材料：《高通量測序與高性能計(jì)算理論和實(shí)踐》北京科學(xué)技術(shù)出版社。
報(bào)名優(yōu)惠政策：
1、2019.3.18日前報(bào)名并繳費(fèi)，可享受減免200元優(yōu)惠。
2、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；
3、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；
4、上面3種優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種。
老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。
培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。
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