- 會議時間： 2019-08-21至 2019-08-23
- 會議地點： 北京
- 電話：18618295767
- 傳真：暫無
- 聯系人：張老師
- Email： bcc_peixun@163.com
- 聯系地址：北京市海淀區豐賢中路7號北科產業3號樓
- 會議網址：
近年來，隨著高通量測序技術的迅猛發展，轉錄組研究從以前的微陣列技術，SAGE及MPSS技術的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉錄組學作為一個伴隨高通量測序技術率先發展起來的技術開始在生物學前沿研究中得到了廣泛的應用。RNA-seq對于真核生物的基因表達調控，癌癥等疾病的發生機制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉錄組高通量測序技術原理、實驗設計以及后期數據分析技能，北京市計算中心生物計算事業部舉辦“轉錄組學”培訓研討班。
主辦單位：中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專委會
承辦單位：北京市計算中心
培訓地點：北京海淀區豐賢中路7號3號樓
培訓時間： 2019.8.21-23上午：9:30-11:30下午：13:30-17:00
一、轉錄組學前沿概述
1. 轉錄組技術發展前沿動態
2. 轉錄組應用案例及應用熱點
二、轉錄組學實驗和分析基礎
1. 轉錄組學研究的實驗技術
2. 轉錄組技術流程及技術細節（重點講解）
3. 常用的轉錄組測序建庫技術
三、轉錄組學中lncRNA的研究
1. lncRNA目前的定義、應用和發展
2. lncRNA的生物學過程（重點講解）
3. lncRNA的測序（重點講解）
4. lncRNA測序數據分析案例展示（重點講解）
四、Linux基礎操作
1. Linux基礎操作
五、De novo轉錄組數據分析上機實踐
1. 原始測序數據的檢測和預處理（重點講解）
2. 使用Trinity拼接轉錄組數據（重點講解）
3. 原始數據與拼接轉錄本的比對（重點講解）
4. 表達量統計和差異表達分析（重點講解）
5. 使用blast對轉錄本進行功能注釋（重點講解）
6. 尋找轉錄本的ORF，翻譯蛋白質序列
六、Reference based轉錄組數據分析上機實踐（一）
1. 轉錄組數據準備和軟件介紹
2. 使用Tophat進行轉錄組數據的比對（重點講解）
3. 用IGV查看比對結果
4. 使用cufflinks進行表達量估計和分析（重點講解）
5. 使用samtools檢測轉錄組數據中的突變（重點講解）
6. 利用DAVID數據庫進行差異表達基因的功能分析（重點講解）
七、Reference based轉錄組數據分析上機實踐（二）
1. 利用tophat和cufflinks組合，預測轉錄本
2. 使用CNCI預測新的lncRNA轉錄本（重點講解）
3. 使用LncTar軟件預測lncRNA調控的靶基因（重點講解）
八、microRNA測序與數據分析（包含上機實踐）
1. microRNA目前的應用、發展歷史以及microRNA的定義
2. microRNA的生物學過程（重點講解）
3. microRNA的測序（重點講解）
4. microRNA測序數據分析軟件（重點講解）
5. microRNA測序數據預處理（重點講解）
6. microRNA的預測（重點講解）
7. microRNA靶標基因預測，結果提取、統計（重點講解）
(課程內容以實際授課為準)
注：參加培訓班的學員投稿《中國生物工程雜志》，通過審稿的論文將會優先發表。
報名費用
培訓費：4000元/人（含聽課費、資料費、上機費，請自帶筆記本電腦以備上機實踐使用）。材料：《高通量測序與高性能計算理論和實踐》北京科學技術出版社。
報名優惠政策
1、8.1日前報名繳費的學員每人可優惠200元，
2、3人以上團體報名每人可減少300元；
3、4+1團報，可免費贈送一個名額；
4、同時報2個及以上培訓班的可額外優惠200元；
5、上面4種優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種。
老學員參加及推薦學員參加均可額外優惠200元。
培訓以收到學員培訓費為成功報名，培訓座位按收到費用先后順序安排。
聯系方式：
QQ號：3498448850
張老師? 18618295767(微信同號）
郵箱：bcc_peixun@163.com
注：開課前一周會發送郵件通知，若未接到郵件通知，請電話咨詢
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