生物分子互作專(zhuān)題研討會(huì)

計(jì)算生物學(xué)是一門(mén)典型的交叉學(xué)科，涉及的學(xué)科包括數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、化學(xué)、物理學(xué)、生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)等。就整個(gè)學(xué)科的內(nèi)容而論，計(jì)算生物學(xué)最終是以生命科學(xué)中的現(xiàn)象和規(guī)律作為研究對(duì)象，以解決生物學(xué)問(wèn)題為最終目標(biāo)，數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)僅僅是解決問(wèn)題的工具和手段。

計(jì)算生物學(xué)領(lǐng)域的研究進(jìn)展極大地加深了我們對(duì)和疾病密切相關(guān)的分子靶標(biāo)的認(rèn)識(shí)。所有生命過(guò)程的實(shí)現(xiàn)都是相應(yīng)蛋白質(zhì)發(fā)揮相應(yīng)功能實(shí)現(xiàn)的，然而，如何有效地利用基本生物學(xué)信息，還需要我們從分子甚至原子水平上來(lái)掌握生物大分子的三維結(jié)構(gòu)和相關(guān)分子之間（蛋白質(zhì)、核酸、小分子）的相互作用，進(jìn)而針對(duì)疾病靶標(biāo)來(lái)設(shè)計(jì)治療性藥物。

本研討班旨在具體分析蛋白質(zhì)與相關(guān)分子（蛋白質(zhì)、核酸、小分子）之間的相互作用，進(jìn)而為生命現(xiàn)象的解釋及疾病靶標(biāo)的改造提供支撐。

本次研討班分為四個(gè)階段

1、掌握必備的基礎(chǔ)知識(shí)

深刻解讀蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)文件、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)獲取，蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)展示，相關(guān)軟件安裝和操作等。

2、掌握相關(guān)分子構(gòu)建流程

以實(shí)際操作為例，形象展示相關(guān)分子（蛋白質(zhì)、核酸、小分子）的構(gòu)建流程及相關(guān)分子（蛋白質(zhì)、核酸、小分子）三維結(jié)構(gòu)查看，為后續(xù)生物分子互作奠定基礎(chǔ)。

3、生物分子互作研究

以蛋白-小分子體系為例，詳細(xì)介紹生物分子互作的研究方法、研究過(guò)程及后續(xù)結(jié)果分析。

4、靶蛋白與相關(guān)藥物分子互作研究

以一個(gè)具體靶蛋白，多個(gè)相關(guān)藥物分子為例，進(jìn)行靶蛋白相關(guān)藥物分子篩選研究。

主辦單位：北京市計(jì)算中心

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓

課程內(nèi)容：

2019年9月26-28日? 9：30-12：00，13：30-17：00

一、生物分子互作簡(jiǎn)介

1. 生物分子互作原理

2. 生物分子互作研究方法介紹

二、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)

1. RCSB PDB數(shù)據(jù)庫(kù)介紹及使用

2. RCSB PDB數(shù)據(jù)庫(kù)的使用

3. PDB文件格式詳解

三、蛋白結(jié)構(gòu)分析及生物分子構(gòu)建

1.分子互作可視化軟件Pymol、Chimera介紹

2. Pymol軟件使用

3. Chimera軟件使用簡(jiǎn)介

4.同源建模原理介紹

5. Swiss-model在線(xiàn)同源建模

6. 實(shí)例講解與練習(xí)

7.Chimera等軟件核酸結(jié)構(gòu)構(gòu)建

8.小分子結(jié)構(gòu)構(gòu)建

四、分子對(duì)接（蛋白-小分子）

1.分子對(duì)接理論介紹

2. 分子對(duì)接軟件Autodock軟件介紹

3. 分子對(duì)接軟件(Autodock)的使用

4. 實(shí)例講解與練習(xí)

五、分子對(duì)接（蛋白-蛋白、蛋白-核酸）

1.大分子對(duì)接現(xiàn)狀分析

2.z-dock軟件介紹與使用

3. 實(shí)例講解與練習(xí)

六、虛擬篩選

1.計(jì)算機(jī)輔助虛擬篩選介紹

2. ZINC等小分子數(shù)據(jù)庫(kù)介紹與應(yīng)用

3. Autodock vina介紹及使用

4. 多體系數(shù)據(jù)庫(kù)虛擬篩選實(shí)例與練習(xí)

七、藥物先導(dǎo)化合物設(shè)計(jì)與改造及文章作圖

1. 以蛋白-小分子為例，在生物和化學(xué)基礎(chǔ)上闡述藥物改造機(jī)制

2.科研論文作圖注意事項(xiàng)

3. 科研論文繪圖實(shí)例操作

4.相關(guān)問(wèn)題解答

講師介紹：

講師團(tuán)隊(duì)具有豐富實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)、一線(xiàn)分析人員親自授課；

劉 博士， 博士畢業(yè)于北京師范大學(xué)，北京市科學(xué)技術(shù)研究院博士后，北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部生物信息工程師。主要研究方向?yàn)樯锎蠓肿咏Y(jié)構(gòu)功能關(guān)系分析、生物分子互作及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)研究。

裴老師

博士，北京市科學(xué)技術(shù)研究院副研究員，中國(guó)科學(xué)院北京市基因組所，博士后，北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部生物信息工程師。從事基因組與生物信息學(xué)研究多年，具有良好的遺傳學(xué)及生物信息學(xué)研究背景與技術(shù)，具有大模型數(shù)據(jù)分析能力，從事關(guān)于遺傳學(xué)、蛋白質(zhì)相互作用、基因組學(xué)與生物信息學(xué)工作多年，具有大數(shù)據(jù)分析與機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)工作經(jīng)驗(yàn)。熟悉各種生物學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)專(zhuān)業(yè)軟件與分析方法。具有較豐富的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析、處理與高性能計(jì)算機(jī)的運(yùn)用、程序開(kāi)發(fā)及數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)構(gòu)建工作經(jīng)驗(yàn)。發(fā)表國(guó)內(nèi)外科學(xué)論文十余篇、專(zhuān)利和軟件著作權(quán)多項(xiàng)，參加多項(xiàng)科學(xué)研究項(xiàng)目。

報(bào)名費(fèi)用

注冊(cè)費(fèi)：4000元/人（含聽(tīng)課費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)，請(qǐng)自帶筆記本電腦以備上機(jī)實(shí)踐使用）。材料：《高通量測(cè)序與高性能計(jì)算理論和實(shí)踐》北京科學(xué)技術(shù)出版社。

報(bào)名優(yōu)惠政策

1、2019.7.17日前報(bào)名并繳費(fèi)的學(xué)員每人可優(yōu)惠200元；

2、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

3、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；

4、上面4種優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

聯(lián)系方式

QQ號(hào)：3498448850

張老師 18618295767

郵箱：bcc_peixun@163.com

編輯： 會(huì)議君