轉(zhuǎn)錄組學(xué)專(zhuān)題研討班通知

近年來(lái)，隨著高通量測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組研究從以前的微陣列技術(shù)，SAGE及MPSS技術(shù)的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉(zhuǎn)錄組學(xué)作為一個(gè)伴隨高通量測(cè)序技術(shù)率先發(fā)展起來(lái)的技術(shù)開(kāi)始在生物學(xué)前沿研究中得到了廣泛的應(yīng)用。RNA-seq對(duì)于真核生物的基因表達(dá)調(diào)控，癌癥等疾病的發(fā)生機(jī)制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能，北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部舉辦“轉(zhuǎn)錄組學(xué)”培訓(xùn)研討班。

一、轉(zhuǎn)錄組學(xué)前沿概述

1. 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動(dòng)態(tài)

2. 轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點(diǎn)

二、轉(zhuǎn)錄組學(xué)實(shí)驗(yàn)和分析基礎(chǔ)

1. 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的實(shí)驗(yàn)技術(shù)

2. 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細(xì)節(jié)（重點(diǎn)講解）

3. 常用的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序建庫(kù)技術(shù)

三、轉(zhuǎn)錄組學(xué)中l(wèi)ncRNA的研究

1. lncRNA目前的定義、應(yīng)用和發(fā)展

2. lncRNA的生物學(xué)過(guò)程（重點(diǎn)講解）

3. lncRNA的測(cè)序（重點(diǎn)講解）

4. lncRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點(diǎn)講解）

四、Linux基礎(chǔ)操作

1. Linux基礎(chǔ)操作

五、De novo轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐

1. 原始測(cè)序數(shù)據(jù)的檢測(cè)和預(yù)處理（重點(diǎn)講解）

2. 使用Trinity拼接轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（重點(diǎn)講解）

3. 原始數(shù)據(jù)與拼接轉(zhuǎn)錄本的比對(duì)（重點(diǎn)講解）

4. 表達(dá)量統(tǒng)計(jì)和差異表達(dá)分析（重點(diǎn)講解）

5. 使用blast對(duì)轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋?zhuān)ㄖ攸c(diǎn)講解）

6. 尋找轉(zhuǎn)錄本的ORF，翻譯蛋白質(zhì)序列

六、Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐（一）

1. 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹

2. 使用Tophat進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對(duì)（重點(diǎn)講解）

3. 用IGV查看比對(duì)結(jié)果

4. 使用cufflinks進(jìn)行表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解）

5. 使用samtools檢測(cè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的突變（重點(diǎn)講解）

6. 利用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行差異表達(dá)基因的功能分析（重點(diǎn)講解）

七、Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐（二）

1. 利用tophat和cufflinks組合，預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄本

2. 使用CNCI預(yù)測(cè)新的lncRNA轉(zhuǎn)錄本（重點(diǎn)講解）

3. 使用LncTar軟件預(yù)測(cè)lncRNA調(diào)控的靶基因（重點(diǎn)講解）

八、microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析（包含上機(jī)實(shí)踐）? ?1. microRNA目前的應(yīng)用、發(fā)展歷史以及microRNA的定義

2. microRNA的生物學(xué)過(guò)程（重點(diǎn)講解）

3. microRNA的測(cè)序（重點(diǎn)講解）

4. microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）

5. microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）

6. microRNA的預(yù)測(cè)（重點(diǎn)講解）

7. microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解）

(課程內(nèi)容以實(shí)際授課為準(zhǔn))

注：參加培訓(xùn)班的學(xué)員投稿《中國(guó)生物工程雜志》，通過(guò)審稿的論文將會(huì)優(yōu)先發(fā)表。

報(bào)名費(fèi)用

培訓(xùn)費(fèi)：4000元/人（含聽(tīng)課費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)，請(qǐng)自帶筆記本電腦以備上機(jī)實(shí)踐使用）。材料：《高通量測(cè)序與高性能計(jì)算理論和實(shí)踐》北京科學(xué)技術(shù)出版社。

報(bào)名優(yōu)惠政策

1、8.1日前報(bào)名繳費(fèi)的學(xué)員每人可優(yōu)惠200元，

2、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

3、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；

4、同時(shí)報(bào)2個(gè)及以上培訓(xùn)班的可額外優(yōu)惠200元；

5、上面4種優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種。

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

聯(lián)系方式

QQ號(hào)：3498448850

張老師18618295767(微信同號(hào)）? ? 郵箱：bcc_peixun@163.com

【注】開(kāi)課前一周會(huì)發(fā)送郵件通知，若未接到郵件通知，請(qǐng)電話(huà)咨詢(xún)

主辦單位：北京市計(jì)算中心

編輯： 會(huì)議君