- 會議時間: 2019-11-23至 2019-11-24
- 會議地點: 北京
- 電話:13621834129
- 傳真:暫無
- 聯系人:王老師
- Email: msh088@126.com
- 聯系地址:
- 會議網址:
用R語言進行科研數據挖掘實戰會議
無實驗無數據沒關系,挖掘別人的數據,發表自己的文章
兩天一夜高強度實訓,講究實戰,所有經驗和盤托出
會后贈講課錄像便于反復復習保障效果(加密播放不零售,保障學員優勢權利)
第十五期?2019/11/23-24 ?北京(會議時間兩天&一晚)
第十六期?2019/12/14-15??上海(會議時間兩天&一晚)
莫速乎主辦??
還在認為沒有實驗就不能發表論文?還在為不精通挖掘GEO,TCGA,SEER的數據庫而痛苦不堪?還在為不知道如何找課題找靶點而苦惱?還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神?快來參加莫速乎的科研數據挖掘實戰專題學習班吧,挖掘別人的數據,發表自己的文章,一次學習,不再報班!
本會議由于帶著明確的目的性去學習R語言,且針對有/無R語言基礎的學員均具有很大寬容性,自開班起就廣受好評。隨著近年來生物信息學技術的普及,R語言是每個科研工作者都有必要掌握的技能,以往漫無目的的學習R效果不理想,用R去進行科研數據挖掘,既學習了R又解決了實際科研問題。?
學完課程并掌握后能干什么:
1.沒有課題的時候找到課題,沒有機制的時候挖掘機制
2.為基金申請保駕護航,發表paper如虎添翼
3.掌握R語言的核心技能,GEO,TCGA,SEER的數據處理沒有壓力
4.科研繪圖:以一敵百,高端大氣,私人訂制。?
這是一份帶有誠意且注重實戰的數據挖掘課程。
我們的目標是:一次學習,不再報班。?
課程特點:
1.不留秘密,私貨全出,全程只用R語言,關鍵步驟不隱藏。
2.第一天晚上時間充分利用,增加帶有講師指導的練習,更多的訓練時間,更好的掌握。
3.講最核心的知識,講通用的技能,學后可應用到其他數據庫的挖掘。
4.實例操作(至少3個套路),讓你快速掌握數據挖掘套路。
5.現場完成一篇paper的思路以及圖表。?
主講人簡介:果子老師,在生信方面具有豐富經驗,本次進行兩天一晚的高強度實操訓練,目標是讓大家一次學習不再報班。講師已在生信網站及公眾號發布上萬條生信相關帖子。作為臨床科研工作者,深知無課題之苦,因此愿將所學知識和盤托出,沒有隱藏。致力于給非生信專業人員普及生物信息學,擅長各種組學的處理,且講課詼諧幽默。?
?
適合人群:廣大臨床/科研工作者及心有熱血被困囚籠的研究生
內容安排
第一天
08:30-11:55
R語言基礎知識介紹
R語言數據結構以及循環控制(向量,因子,矩陣,數據框,列表,for循環,if控制)
編寫自己的第一個批量處理數據的程序
R語言中數據框的操作(增刪改查)
真實數據的清洗和整理
R包以及bioconductor資源的使用
R包無敵安裝攻略
R語言繪圖系統
11:55-13:30
統一午餐
13:30-17:00
TCGA數據庫背景介紹+閱讀文獻
TCGA相關的網頁工具匯總學習
介紹不同的癌癥和不同組學
不同的分析套路解讀(WGCNA,signatures,miRNA-mRNA配對或者ceRNA等)
TCGA數據分析的軟硬件準備
下載及理解TCGA數據(所有數據)
R制作TCGA表型數據臨床三線表
17:00-18:00
統一晚餐
晚上
18:00-21:00
R語言數據框的操作練習(掌握tidyr和dplyr)
GEO數據庫成套流程實戰(數據清洗,熱圖,火山圖,氣泡圖)
如何根據需求繪制一個漂亮的火山圖(學習ggplot2)
使用R語言制作特定腫瘤所有基因表達的數據庫
第一天答疑,消化,為第二天做準備
第二天
08:30-11:55
差異分析(表達數據,表達矩陣歸一化,DESeq2)
任意癌癥任意基因在癌和癌旁的表達
如果有亞型,在不同亞型中的表達
如果有腫瘤有分期,在不同臨床分期中的表達
單個基因在多個正常組織中的表達
單個基因在多個細胞系中的表達
單個基因在多個腫瘤中的表達
兩個基因的相關性如何分析
聚類注釋與圖表展示(GO/KEGG,GSEA)
使用多種統計算法定位 signatures cox,lasso回歸
生存分析
繪圖美化
任意癌癥中任意基因的生存分析
任意癌癥中批量生存分析
TCGA文章的框架分析以及復現
答疑環節
11:55-13:00
統一午餐
13:00-16:30
利用GEO和TCGA數據庫找到課題
利用GEO和TCGA數據庫發掘下游機制
如何利用GEO和TCGA數據庫申請基金
如何利用GEO和TCGA數據庫發表文章
現場完成一篇生信文章的所有圖表
提出科研假設
根據科研假設下載整理數據導入R語言 ??????????????????????????????
在R語言中清洗和整理數據達到對應R包的要求
數據處理過程中調整分析策略
繪制各個部分需要的圖標?
時間地點:
第十五期?2019/11/23-24(22日報到)??
北京金盞花酒店(會議時間兩天&一晚)
地址:北京市豐臺區萬豐路312號,地鐵9號線七里莊站A2口出500米?
第十六期?2019/12/14-15(13日報到)??
上海維也納酒店天山西路店(會議時間兩天&一晚)
地址:上海市閔行區天山西路4086號,地鐵2/10號線虹橋地鐵站
注冊費用:3400元/人 ?按交費先后順序安排座次,注冊費包含會場、教材、午餐、視頻課程等費用,不含住宿費。
主辦單位:上海莫速乎教育投資有限公司、上海荊麥信息科技中心
報名咨詢:王老師 ?136 2183 4129 (微信同號)?msh088@126.com
歡迎來電或微信聯系索取word函件及報名回執表,謝謝!
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