轉(zhuǎn)錄組學(xué)專題研討班（1月班）

近年來，隨著高通量測序技術(shù)的迅猛發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組研究從以前的微陣列技術(shù)，SAGE及MPSS技術(shù)的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉(zhuǎn)錄組學(xué)作為一個伴隨高通量測序技術(shù)率先發(fā)展起來的技術(shù)開始在生物學(xué)前沿研究中得到了廣泛的應(yīng)用。RNA-seq對于真核生物的基因表達(dá)調(diào)控，癌癥等疾病的發(fā)生機(jī)制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉(zhuǎn)錄組高通量測序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計以及后期數(shù)據(jù)分析技能，北京市計算中心生物計算事業(yè)部舉辦“轉(zhuǎn)錄組學(xué)”培訓(xùn)研討班。

一、轉(zhuǎn)錄組學(xué)前沿概述

1. 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動態(tài)

2. 轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點(diǎn)

二、轉(zhuǎn)錄組學(xué)實(shí)驗(yàn)和分析基礎(chǔ)

1. 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的實(shí)驗(yàn)技術(shù)

2. 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細(xì)節(jié)（重點(diǎn)講解）

3. 常用的轉(zhuǎn)錄組測序建庫技術(shù)

三、Linux基礎(chǔ)操作

1. Linux基礎(chǔ)操作

四、De novo轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐

1. 原始測序數(shù)據(jù)的檢測和預(yù)處理（重點(diǎn)講解）

2. 使用Trinity拼接轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（重點(diǎn)講解）

3. 原始數(shù)據(jù)與拼接轉(zhuǎn)錄本的比對（重點(diǎn)講解）

4. 表達(dá)量統(tǒng)計和差異表達(dá)分析（重點(diǎn)講解）

5. 使用blast對轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋（重點(diǎn)講解）

6. 尋找轉(zhuǎn)錄本的ORF，翻譯蛋白質(zhì)序列

7. 轉(zhuǎn)錄因子注釋

五、Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐（一）

1. 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹

2. 使用Tophat進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對（重點(diǎn)講解）

3. 用IGV查看比對結(jié)果

4. 使用cufflinks進(jìn)行表達(dá)量估計和分析（重點(diǎn)講解）

5. 使用samtools檢測轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的突變（重點(diǎn)講解）

6. 差異表達(dá)基因的功能分析（重點(diǎn)講解）

六、Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐（二）

1. lncRNA目前的定義、應(yīng)用和發(fā)展

2. lncRNA的生物學(xué)過程（重點(diǎn)講解）

3. lncRNA的測序（重點(diǎn)講解）

4. lncRNA測序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點(diǎn)講解）

5. 利用tophat和cufflinks組合，預(yù)測轉(zhuǎn)錄本

6. 使用CNCI預(yù)測新的lncRNA轉(zhuǎn)錄本（重點(diǎn)講解）

7. 使用LncTar軟件預(yù)測lncRNA調(diào)控的靶基因（重點(diǎn)講解）

七、microRNA測序與數(shù)據(jù)分析（包含上機(jī)實(shí)踐）

1. microRNA目前的應(yīng)用、發(fā)展歷史以及microRNA的定義

2. microRNA的生物學(xué)過程（重點(diǎn)講解）

3. microRNA的測序（重點(diǎn)講解）

4. microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）

5. microRNA測序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）

6. microRNA的預(yù)測（重點(diǎn)講解）

7. microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測，結(jié)果提取、統(tǒng)計（重點(diǎn)講解）

八、10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)常規(guī)分析流程介紹及實(shí)操

1. 10x單細(xì)胞測序技術(shù)在科研領(lǐng)域的應(yīng)用

2. 10x單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)建庫原理介紹

3. 10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組下機(jī)數(shù)據(jù)處理

4. 10x單細(xì)胞軟件Cellranger講解及實(shí)操（重點(diǎn)講解）

5. 從單細(xì)胞表達(dá)矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實(shí)操

(課程內(nèi)容以實(shí)際授課為準(zhǔn))

注：參加培訓(xùn)班的學(xué)員投稿《中國生物工程雜志》，通過審稿的論文將會優(yōu)先發(fā)表。

報名費(fèi)用

培訓(xùn)費(fèi)：4000元/人（含聽課費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)，請自帶筆記本電腦以備上機(jī)實(shí)踐使用）。材料：《高通量測序與高性能計算理論和實(shí)踐》北京科學(xué)技術(shù)出版社。

報名費(fèi)用

注冊費(fèi)：4500元/人（含聽課費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)，請自帶筆記本電腦以備上機(jī)實(shí)踐使用）。培訓(xùn)期間，免費(fèi)提供工作午餐。

付費(fèi)方式

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款

單位全稱：北京市計算中心

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息里備注上：“生物計算事業(yè)部——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱）

報名優(yōu)惠政策

1、2019.12.25之前報名并繳費(fèi)的學(xué)員每人可優(yōu)惠200元；

2、3人以上團(tuán)體報名每人可減少300元；

3、4+1團(tuán)報，可免費(fèi)贈送一個名額；

4、上面3種優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種。

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

咨詢請聯(lián)系

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張老師 18618295767(微信同號）,? 郵箱：bcc_peixun@163.com

編輯： 會議君