微生物組學數據分析與挖掘專題培訓班

微生物組學數據分析與挖掘專題培訓班

微生物存在于世界的各個角落，在醫療健康、環境治理、農業種植、工業生產等諸多領域發揮著舉足輕重的作用。近年來，隨著測序技術的發展，對于微生物組學的研究持續火熱。微生物組學技術現已成為了科研工作者必不可少的研究技術，進而，對其技能要求也是越來越高。尤其是數據庫建立、編程語言開發、繪圖工具使用技巧及算法模型選擇等，已成為廣大科研工作者面臨的具體問題。

舉 辦 地：北京市海淀區豐賢中路7號北科產業3號樓

課程內容：

2020年2月12-14日上午：9:30-11:30下午：13:30-17:00

一、微生物組學研究現狀及應用

1、微生物組學研究現狀及應用

2、微生物組數據分析流程設計

3、常用數據庫介紹

4、方案設計與案例分享

二、微生物組學數據分析上機基礎

1、Linux常用命令使用和上機操作

2、Linux環境下軟件安裝

三、微生物多樣性數據分析

1、質控流程：雙端序列合并、提取barcode、質控、樣品拆分、切除引物

2、生成OTU：序列格式轉換、去冗余、聚類生成OTU

3、OTU篩選：嵌合體生成原理及去除方法、篩選細菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表

4、物種注釋及進化樹構建

5、常用Alpha多樣性指數計算

6、常用Beta多樣性距離矩陣計算

7、統計分析

7.1、箱線圖展示Alpha多樣性及組間比較統計

7.2、散點圖展示樣品及組間主坐軸分析(PCA/PCoA/NMDS)

7.3、樣品與組間相關分析，并用熱圖可視化結果

四、宏基因組數據分析與結果解讀

1、宏基因組分析基本策略

2、數據質量評估

3、數據質量過濾

4、宿主污染過濾

5、數據組裝

6、基因預測

7、物種注釋（MEGAN、Krona）

8、功能注釋（KEGG、eggNOG）

9、統計分析

聚類分析（物種、功能、基因）

差異分析（物種、功能、基因）

10、常用分析圖表在文章中意義和使用場景

五、數據挖掘與可視化實現

1、R繪圖功能在微生物組學信息分析中的應用

韋恩圖、花瓣圖、散點圖、熱圖、盒形圖（箱線圖）等

2、網絡分析 MENA IgraphCytoscape

3、物種與樣本關系 Circos分析

4、差異物種分析 LEfSe分析

5、KEGG和COG預測分析 PIRUSt和STAMP

6、進化分析 ITOL

【報名費用】

注冊費：3500元/人（含聽課費、資料費、上機費，請自帶筆記本電腦以備上機實踐使用）。培訓期間，免費提供工作午餐。

【付費方式】

現金、支票、銀行轉賬、銀行匯款

單位全稱：北京市計算中心

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息里備注上：“生物計算事業部——您的姓名”，個人匯款請備注單位名稱）

【報名優惠政策】

1、2020.1.10之前報名并繳費的學員每人可優惠200元；

2、3人以上團體報名每人可減少300元；

3、4+1團報，可免費贈送一個名額；

4、上面3種優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種。

老學員參加及推薦學員參加均可額外優惠200元。

培訓以收到學員培訓費為成功報名，培訓座位按收到費用先后順序安排。

【咨詢請聯系】

QQ號：3498448850

張老師 18618295767(微信同號）,?

郵箱：bcc_peixun@163.com

編輯： 會議君