生物醫學公共數據深度挖掘及應用培訓班

生物醫學公共數據深度挖掘及應用培訓班

還在認為沒有實驗就不能發表論文？

手頭有很多數據，不知道該怎么進一步挖掘？

還在為不知道如何找靶點而苦惱？

還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數據庫而痛苦不堪？

還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神？

快來參加北京市計算中心舉辦的生物醫學公共數據深度挖掘及應用培訓班吧！

本次培訓對目前公共數據挖掘熱點進行系統介紹，提供一次系統了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數據庫數據產生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數據庫挖掘多組學數據，以便為自身科研項目服務。

授課對象：

從事生物醫學研究的臨床醫生、轉化研究科研人員；

課題經費不足，無法進行大規模測序，但需要發表SCI論文的相關研究人員；

已獲得轉錄組、基因組等多組學數據，需要進一步挖掘分析人員；

對生物醫學大數據分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓效果：

跟蹤公共數據挖掘前沿熱點，沒有課題的時候找到課題；

短、平、快，為基金申請保駕護航，發表paper如虎添翼；

掌握多組學數據分析核心技能，GEO、TCGA、SRA數據處理沒有壓力；

科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；

一套數據多角度演練，更易掌握分析思路。

舉辦地：北京市海淀區豐賢中路7號北科產業3號樓

課程安排：

2020年2月18-21日? 9:30-12:00，13:30-17:00

課程內容

一、公共數據庫挖掘熱點介紹

疾病診斷biomarker鑒定、疾病預后biomarker鑒定、可變剪切與預后相關分析、腫瘤免疫分析、多組學泛癌癥分析、人工智能研究在病理切片識別上的應用、人工智能多組學數據整合分析

二、常用生物醫學數據庫介紹

常用生物醫學數據庫介紹：

大型綜合數據庫：NCBI、UCSC

公共高通量測序數據庫：SRA

公共基因表達譜數據庫：GEO

公共癌癥多組學數據庫：TCGA

三、各大數據庫數據下載

R語言基礎? ? ?R語言、Rstudio、Bioconductor使用

R語言基礎語法、擴展包安裝方法

R語言讀入數據、數據基礎調用

四、基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（一）

差異表達分析及結果可視化：

1）edgeR包使用

2）火山圖繪制

3）聚類熱圖繪制

五、GO、KEGG功能富集分析及結果可視化：

1）GO富集分析

2）KEGG富集分析

3）富集分析氣泡圖繪制

六、基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（二）

基因/蛋白互作網絡構建、網絡關鍵節點識別

1）利用string數據庫查詢基因/蛋白相互作用

2）利用cytoscape工具構建相互作用網絡

3）網絡拓撲結構分析、關鍵基因識別

七、基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（三）

預后相關性分析、生存曲線、ROC曲線繪制：

1）利用R包進行單因素及多因素預后分析

2）生存曲線繪制、生存曲線差異顯著性分析

3）RISK score計算及結果可視化

八、多組學數據聯合分析演練（一）

甲基化與轉錄組整合分析思路演練

1）甲基化數據預處理

2）差異甲基化位點及區域識別

3）甲基化與轉錄組數據聯合分析

4）公共表觀數據庫：ENCODE、regulomeDB

九、多組學數據聯合分析演練（二）

lncRNA-miRNA-mRNA全轉錄組整合分析思路演練

1）lncRNA表達譜數據獲取

2）miRNA靶基因分析

3）lncRNA與mRNA表達相關性分析

4）ceRNA網絡構建及結果可視化

討論與答疑

講師介紹：

講師團隊具有豐富實踐經驗，由一線分析人員親自授課。

裴老師，博士，北京市科學技術研究院副研究員，中國科學院北京市基因組所博士后，北京市計算中心生物計算事業部生物信息工程師。從事基因組與生物信息學研究多年，具有良好的遺傳學及生物信息學研究背景與技術，具有大模型數據分析能力，從事關于遺傳學、基因組學與生物信息學工作多年，具有大數據分析與機器學習技術工作經驗。熟悉各種生物學與統計學專業軟件與分析方法。具有較豐富的生物信息學數據分析、處理與高性能計算機的運用、程序開發及數據庫平臺構建工作經驗。

劉老師，博士，助理研究員，博士畢業于中國科學院北京市基因組所，北京市計算中心生物計算事業部生物信息工程師。具有豐富的外顯子組、轉錄組等測序數據分析，疾病基因組數據解讀，公共數據庫數據挖掘與二次開發經驗。具有豐富的生物信息學技術培訓授課經驗。

袁老師，北京市計算中心生物計算事業部生物信息工程師。本科就讀于山東大學生命科學專業，碩士就讀于軍事科學院生物信息專業。精通R、Python、Shell Script等編程語言，在Linux服務器運維、集群搭建、docker容器技術、數據庫及網站搭建方面有一定經驗，熟悉臨床相關的組學生物信息分析。

【報名費用】

注冊費：4500元/人（含聽課費、資料費、上機費，請自帶筆記本電腦以備上機實踐使用）。培訓期間，免費提供工作午餐。

【付費方式】

現金、支票、銀行轉賬、銀行匯款

單位全稱：北京市計算中心

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息里備注上：“生物計算事業部——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱）

【報名優惠政策】

1、2020.1.10之前報名并繳費，可享受減免200元優惠；

2、3人以上團體報名每人可減少300元；

3、4+1團報，可免費贈送一個名額；

4、上面3種優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；

老學員參加及推薦學員參加均可額外優惠200元。

培訓以收到學員培訓費為成功報名，培訓座位按收到費用先后順序安排。

【咨詢請聯系】

QQ號：3498448850

張老師 18618295767(微信同號）,??

郵箱：bcc_peixun@163.com

編輯： 會議君