基因組關聯分析技術應用研討會

作者： 2020-01-19

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會議時間： 2020-03-11至 2020-03-14
會議地點：北京
電話：18618295767
傳真：
聯系人：張老師
Email： bcc_peixun@163.com
聯系地址：北京市海淀區豐賢中路7號北科產業3號樓
會議網址：

隨著測序技術的發展，產生了海量的基因型數據，然而如何將基因型與表型進行關聯，從而定位復雜疾病風險基因或農業動植物重要經濟性狀相關的遺傳變異卻是一項巨大挑戰。在過去的十年間，借助全基因組關聯分析（GWAS），科研人員發掘了大量與人類復雜疾病和農業動植物重要經濟性狀相關的遺傳變異。

北京市計算中心生物計算事業部，在基因組關聯分析領域具有豐富經驗，發表多篇領域頂級雜志。針對具備一定統計學、遺傳學、分子生物學基礎的生物醫學領域研究人員，特開設基因組關聯分析培訓班。

無需任何計算機語言基礎；

深入淺出，內容精要實用；

結合人類醫學、動植物育種等生物學數據背景知識與實例講授；

統計學原理+模型/算法+編程實現+生物醫學應用；

授課老師經驗豐富，邊學邊練，重實踐，力求實效；

小班授課，個別輔導。

主辦單位：北京市計算中心

課程安排：

2020年3月11日? 13:30-17:00（選擇性參加）

2020年3月12-14日? 9:30-12:00，13:30-17:00

課程內容：

一、GWAS計算機基礎（選擇性參加）

1、Linux基礎for GWAS

2、R基礎for GWAS

二、基因組關聯分析理論基礎

1、基因組學與生物信息學概述

2、基于群體遺傳的數據獲取

3、基因組關聯分析的原理、數模、策略及常用軟件介紹

4、常用GWAS數據庫介紹

三、Plink軟件基礎應用

1、Plink軟件應用

2、Plink文件格式生成與解析

3、等位基因頻率計算

4、哈-溫平衡計算

5、基因組關聯分析流程

6、關聯分析結果分析與p校正

四、基因型填充Imputation

1、基因型填充Imputation的原理及應用

2、基因型填充軟件介紹與應用

3、基因組填充的方法與分析流程

4、1000G數據應用

五、Plink軟件進階應用

1、基于家系的關聯分析

2、曼哈頓圖的繪制與結果展示

3、實操for Plink

六、Haploview軟件

1、Haploview軟件應用

2、Haplotype單倍型分析

3、LD連鎖不平衡指數計算

4、實操for Haploview軟件

七、Tassel軟件

1、Tassel軟件應用

2、Tassel基于命令行的批量數據分析

3、生物多樣性指數、PCA、遺傳距離計算等

4、實操for Tassel軟件

講師介紹：

講師團隊具有豐富實踐經驗，由一線分析人員親自授課。

裴老師，博士，北京市科學技術研究院副研究員，中國科學院北京市基因組所博士后，北京市計算中心生物計算事業部生物信息工程師。從事基因組與生物信息學研究多年，具有良好的遺傳學及生物信息學研究背景與技術，具有大模型數據分析能力，從事關于遺傳學、基因組學與生物信息學工作多年，具有大數據分析與機器學習技術工作經驗。熟悉各種生物學與統計學專業軟件與分析方法。具有較豐富的生物信息學數據分析、處理與高性能計算機的運用、程序開發及數據庫平臺構建工作經驗。在關聯分析領域，其研究成果發表在《Immunology》、《JASN》、《Kidney International》等頂級雜志。

聞老師，北京市計算中心生物信息工程師。畢業于軍事科學院，研究方向為神經退行性疾病的蛋白質組學研究和電生理學數據挖掘，曾參與國自然、973計劃等重大項目，在國際期刊參與表發學術論文4篇。擅長大數據統計學分析和數據挖掘，具有豐富的遺傳流行病學、單細胞基因組學、三維基因組學、蛋白質組學的課題設計和數據分析及生物信息學技術培訓經驗。

袁老師，北京市計算中心生物計算事業部生物信息工程師。本科就讀于山東大學生命科學專業，碩士就讀于軍事科學院生物信息專業。精通R、Python、Shell Script等編程語言，在Linux服務器運維、集群搭建、docker容器技術、數據庫與網站搭建及臨床相關的組學生物信息分析方面有著豐富經驗。

報名費用

方案課程內容注冊費

方案一第一天至第三天（3天）4000元/人

方案二第0天至第三天（3.5天）4600元/人

付費方式

現金、支票、銀行轉賬、銀行匯款

單位全稱：北京市計算中心

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息里備注上：“生物計算事業部——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱）

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