【線上直播】微生物組學數據分析與挖掘專題培訓班

微生物存在于世界的各個角落，在醫療健康、環境治理、農業種植、工業生產等諸多領域發揮著舉足輕重的作用。近年來，隨著測序技術的發展，微生物組學研究持續火熱，微生物組學技術已成為微生物研究領域科研工作者必不可少的研究技術，對其技能要求也越來越高。針對廣大科研工作者在運用微生物組學技術開展研究工作中面臨的問題，計算中心開發了數據庫建立、編程語言開發、繪圖工具使用技巧及算法模型選擇等一系列培訓課程，歡迎大家報名參加。

主辦單位：北京市計算中心

授課形式：線上直播

課程安排：2020年3月26-4月1日

一、微生物組學研究現狀及應用

1、宏基因組測序技術概述

2、宏基因組的研究思路

3、三種宏基因組測序方案

4、常用數據庫介紹

二、微生物組學數據分析上機基礎

1、Linux常用命令使用和上機操作

2、Linux環境下軟件安裝

三、微生物多樣性數據分析

1、質控流程：雙端序列合并、提取barcode、質控、樣品拆分、切除引物

2、生成OTU：序列格式轉換、去冗余、聚類生成OTU

3、OTU篩選：嵌合體生成原理及去除方法、篩選細菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表

4、物種注釋及進化樹構建

5、常用Alpha多樣性指數計算

6、常用Beta多樣性距離矩陣計算

7、統計分析

7.1、Alpha多樣性及組間比較統計

7.2、散點圖展示樣品及組間主坐軸分析(PCA/PCoA/NMDS)

7.3、樣品與組間相關分析，并用熱圖可視化結果

四、宏基因組數據分析（一）

1、宏基因組分析基本策略

2、數據質量評估

3、數據質量過濾

4、宿主污染過濾

5、數據組裝

五、宏基因組數據分析（二）

1、基因預測

2、物種注釋（MEGAN）

3、功能注釋（KEGG、eggNOG）

4、統計分析

聚類分析（物種、功能、基因）

差異分析（物種、功能、基因）

六、數據挖掘與可視化實現（一）

R語言基礎及R語言繪圖

七、數據挖掘與可視化實現（二）

1、報告解讀及常用分析圖表在文章中意義

2、R繪圖功能在微生物組學信息分析中的應用

韋恩圖、花瓣圖、散點圖、熱圖、盒形圖（箱線圖）等

3、OUT/物種相關性分析

Network分析

4、物種與樣本關系 Circos分析

八、數據挖掘與可視化實現（三）

1、差異物種分析 LEfSe分析

2、KEGG和COG預測分析

PIRUSt和STAMP

3、進化分析 ITOL

報名費用

注冊費：3500元/人（含聽課費、上機賬號1個、線下課程半價優惠券1張），請自備筆記本電腦上機實踐使用。

開具增值稅發票，提供蓋章通知、結業證書等相關材料。

課程結束后，可將上課期間用到的數據、PPT資料、腳本、視頻等相關文檔，通過移動硬盤郵寄的方式快遞到您手上，便于您后續繼續學習使用。

報名優惠政策

1、3人以上團體報名每人可減少300元；

2、4+1團報，可免費贈送一個名額；

3、上面優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；

老學員參加及推薦學員參加均可額外優惠200元。

包年優惠價

按年付費，45000元/人。包括報名后1年以內所有線上課程；高性能計算資源基礎賬號1個，使用期限1年；線下培訓名額2個。

付費方式

單位全稱：北京市計算中心

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息備注：“生物計算——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱）

注：款項支出后，請提供付款回執給工作人員，方便核實到賬、開具發票。

咨詢請聯系

QQ號：3498448850

郵箱：bcc_peixun@163.com

張老師 18618295767（微信同號）

于老師 15621925881

【注】開課前三天會發送郵件通知；確認開課后，開課前一天會將直播鏈接及上機賬號發至您郵箱或微信。如未收到，請及時電話咨詢。

編輯： 會議君