【線上直播】生物醫學公共數據深度挖掘及應用會議

還在認為沒有實驗就不能發表論文？手頭有很多數據，不知道該怎么進一步挖掘？還在為不知道如何找靶點而苦惱？還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數據庫而痛苦不堪？還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神？快來參加北京市計算中心舉辦的生物醫學公共數據深度挖掘及應用培訓班吧！

本次培訓對目前公共數據挖掘熱點進行系統介紹，提供一次系統了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數據庫數據產生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數據庫挖掘多組學數據，以便為自身科研項目服務。歡迎報名參加。

授課對象：

從事生物醫學研究的臨床醫生、轉化研究科研人員；課題經費不足，無法進行大規模測序，但需要發表SCI論文的相關研究人員；已獲得轉錄組、基因組等多組學數據，需要進一步挖掘分析人員；對生物醫學大數據分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓效果：

短、平、快，為基金申請保駕護航，發表paper如虎添翼；掌握多組學數據分析核心技能，GEO、TCGA、SRA數據處理沒有壓力；科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；一套數據多角度演練，更易掌握分析思路。

主辦單位：北京市計算中心

授課形式：線上直播

課程安排：2020年3月28日-4月3日

一、公共數據庫挖掘熱點介紹

1、疾病診斷biomarker鑒定

2、疾病預后biomarker鑒定

3、可變剪切與預后相關分析

4、腫瘤免疫分析

5、多組學泛癌癥分析

6、人工智能研究在病理切片識別上的應用

7、人工智能多組學數據整合分析

二、常用生物醫學數據庫介紹

1、用生物醫學數據庫介紹：

1）大型綜合數據庫：NCBI、UCSC

2）公共高通量測序數據庫：SRA

3）公共基因表達譜數據庫：GEO

4）公共癌癥多組學數據庫：TCGA

2、各大數據庫數據下載

三、R語言基礎

1、R語言簡介

2、R語言安裝及配置

3、R語言數據結構

4、R語言數據處理

5、R語言繪圖

四、基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（一）

1、差異表達分析及結果可視化：

1）edgeR包使用

2）火山圖繪制

3）聚類熱圖繪制

2、GO、KEGG功能富集分析及結果可視化：

1）GO富集分析

2）KEGG富集分析

3）富集分析氣泡圖繪制

五、基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（二）

1、利用string數據庫查詢基因/蛋白相互作用

2、利用cytoscape工具構建相互作用網絡

3、網絡拓撲結構分析、關鍵基因識別

六、基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（三）

預后相關性分析、生存曲線、ROC曲線繪制：

1）利用R包進行單因素及多因素預后分析

2）生存曲線繪制、生存曲線差異顯著性分析

3）RISK score計算及結果可視化

七、多組學數據聯合分析演練（一）

甲基化與轉錄組整合分析思路演練

1）甲基化數據預處理

2）差異甲基化位點及區域識別

3）甲基化與轉錄組數據聯合分析

4）公共表觀數據庫：ENCODE、regulomeDB

八、多組學數據聯合分析演練（二）

lncRNA-miRNA-mRNA全轉錄組整合分析思路演練

1）lncRNA表達譜數據獲取

2）miRNA靶基因分析

3）lncRNA與mRNA表達相關性分析

4）ceRNA網絡構建及結果可視化

報名費用

注冊費：3500元/人（含聽課費、上機賬號1個、線下課程半價優惠券1張），請自備筆記本電腦上機實踐使用。

開具增值稅發票，提供蓋章通知、結業證書等相關材料。

課程結束后，可將上課期間用到的數據、PPT資料、腳本、視頻等相關文檔，通過移動硬盤郵寄的方式快遞到您手上，便于您后續繼續學習使用。

報名優惠政策

1、3人以上團體報名每人可減少300元；

2、4+1團報，可免費贈送一個名額；

3、上面優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；

老學員參加及推薦學員參加均可額外優惠200元。

包年優惠價

按年付費，45000元/人。包括報名后1年以內所有線上課程；高性能計算資源基礎賬號1個，使用期限1年；線下培訓名額2個。

付費方式

單位全稱：北京市計算中心

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息備注：“生物計算——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱）

咨詢請聯系

QQ號：3498448850

郵箱：bcc_peixun@163.com

張老師 18618295767（微信同號）

于老師 15621925881

【注】開課前三天會發送郵件通知；確認開課后，開課前一天會將直播鏈接及上機賬號發至您郵箱或微信。如未收到，請及時電話咨詢。

編輯： 會議君